سومین بخش از مستند « سفری از مرکب تا خون» در ادامه بررسی زندگی شهید اول و این قسمت بیان نظریه حکومت ولایت فقیه در جامعه اسلامی توسط شهید اول برای اولین بار و عملی نمودن این حکومت در بلاد شیعی آن زمان و واکنش حکومت ظالم وقت به این حرکت عظیم انقلابی .