قسمت دوم مستند آبهای جوشان این مستند به موضوع توانمندی ها ، آمادگی، قدرت و اقتدار نیروی دریایی ارتش و سپاه پاسداران انقلاب اسلامی ایران در مقابله با دشمنان می پردازد. در این مستند علاوه بر سخنان مقامات نظامی ایران از مصاحبه های کارشناسان نظامی دیگر کشورها و رژیم صهیونیستی نیز استفاده شده است.