یکی از مهمترین اندامک هایی که در مرگ سلول دچار تغییر می گردد، میتوکندری است. همان طور که به یاد دارید این اندامک کار تولید انرژی را در سلول انجام می دهد. وقتی سلول سیگنال های مرگی را دریافت می کند پتانسیل موجود در میتوکندری دستخوش تغییر شده و سبب می گردد میتوکندری نیز از بین رود.