علت رنگی بودن قندیل های این غار این است که وقتی آب وارد لایه داخلی زمین می شود ممکن است در حین حل کردن آهک به رگه هایی از فلزات و مواد معدنی دیگر برخورد کند و مقداری از آنها را حل کند و با خود به فضای درون غارها ببرد و در زمان شکل گیری این قندیل های آهکی این رنگ در آنها تاثیر بگذارد.