عواملی مثل سیگار کشیدن می توانند پروتئین های خود ما را تغییر داده و آن ها را برای سیستم ایمنی هدف قرار دهند. یکی از انواع این تغییر ها "سیترولینیشن" نامیده می شود. وقتی سیستم ایمنی این پروتئین های تغییریافته را شناسایی می کند، سلول های B، آنتی بادی ها و بعداً سلول های T تشکیل می شوند. در بعضی از بیماران وضعیت آنقدر پیشرفت می کند که با افزایش نفوذپذیری مفصل نسبت به این عوامل آرتریت رخ می دهد.