سلول های جانوری و گیاهی با اینکه در بسیاری از ساختارها با هم مشابه هستند اما دارای اختلافاتی در وجود و یا عدم وجود برخی اندامک ها هستند. به طور مثال در گیاهان دیواره سلولی و پلاست ها وجود دارند که در جانوران نیست و یا در سلول های جانوری سنتروزوم و لیزوزوم وجود دارد که در گیاهان نیست. واکوئل ها در سلول های گیاهان بزرگ و در مرکز اما در سلول های جانوری کوچک و محدود اند.