پروتئین ها روی ژل های مخصوص آورده می شوند و سپس روی برای انتقال پروتئین ها به روی غشا در جریان الکتریکی قرار داده می شوند. برای شناسایی پروتیئن ها آنتی بادی های اولیه و ثانویه مناسب استفاده می شوند.